El Fondo Armada de Chile contiene la sección Comandancia en Jefe de la Armada y está constituido por una serie de manuscritos contenidos en 140 volúmenes que abarca el período desde 1879 a 1945.
Contiene manuscritos relativos a la Guerra del Pacífico, que se produjo durante los años 1879-1884 y que afectó a Chile y a la alianza formada por Perú y Bolivia. Esta colección excluye los manuscritos que están incorporados en otras colecciones, como por ejemplo los del Fondo Armada de Chile.
Publicación que ha reunido las principales actividades ejecutadas a nivel nacional como internacional, en los ámbitos de la Hidrografía y Oceanografía.