El Fondo Armada de Chile contiene la sección Comandancia en Jefe de la Armada y está constituido por una serie de manuscritos contenidos en 140 volúmenes que abarca el período desde 1879 a 1945.
Colección que incluye vistas de los principales faros, balizas y Puestos de Vigías y Señales del litoral , como tambiñen de actividades realizados en estos emplazamientos.
Colección que incluye a las principales escuelas y academias de la Armada, tales como Escuela Naval Arturo Prat, Academia Politécnica Naval Academia de Guerra Navla y Escuela de Grumetes entre otras.
Colección que muestra la arquitectura de los distintos edificios de carácter históricos de la Armada. También se incluyen los principales monumentos de la Armada o referidos a los héroes de la institución. Como principales referentes de la colección se encuentran el edificio de la Comandancia en Jefe de la Armada y el Monumento a los Héroes de Iquique, ambos ubicados en la Plaza Sotomayor en Valparaíso.
